Filmy i dyski tworzone w programie Pinnacle Studio powstają na podstawie projektów tworzonych na osi czasu.

Aby możliwe było zarządzanie projektami w programie Studio, musi być wykonywane śledzenie elementów trafiających na oś czasu oraz wszystkich czynności edycyjnych dotyczących przycinania, dodawania efektów itd. Większość z tych informacji jest przechowywana w pliku projektu o formacie axp (Studio Movie). Na potrzeby funkcji Zatrzymaj ruch projekty są zapisywane w formacie axps.

W celu zaoszczędzenia miejsca na dysku podczas obsługi plików, które mogą być bardzo duże, plik projektu nie obejmuje elementów multimedialnych filmu. W tym przypadku jest zapisywana tylko ich lokalizacja.

Plik projektu axp stanowi domyślny format pliku w poleceniach menu Plik > Otwórz, Plik > Zapisz i Plik > Zapisz jako. Może to być jedyny potrzebny format.

Czasami jednak wygodnie jest mieć wszystkie zasoby wybrane do projektu zgromadzone w jednym zbiorze, którym łatwo zarządzać i który umożliwia bezproblemowe archiwizowanie, przesyłanie czy wczytywanie. Do tego celu został stworzony inny format — axx (Studio Project Package) — zawierający w pojedynczym pliku wszystkie materiały używane w projekcie, łącznie z elementami multimedialnymi. Z konieczności pliki w tym formacie są znacznie większe niż standardowe pliki projektu.

Mimo że bezpośrednie edytowanie projektu w formacie pakietu nie jest możliwe, program Pinnacle Studio pozwala na otwarcie pakietu projektu z użyciem poleceń Plik > Otwórz przez wybranie pozycji axx w polu rozszerzenia pliku. W programie Studio następuje rozpakowanie projektu, utworzenie w Bibliotece pozycji dla wersji rozpakowanej i otwarcie jej do edycji.

Projekt utworzony przy użyciu edytora nagrań z wielu kamer jest zapisywany w postaci pliku mcam. Plik mcam jest domyślnie dodawany do osi czasu jako zagnieżdżony projekt. Można go rozwinąć, klikając dwukrotnie plik na osi czasu i edytując go na odpowiedniej karcie osi czasu. Wszystkie zmiany są zapisywane w głównym projekcie.