Filmy a disky, které vytvoříte v aplikace Pinnacle Studio, se generují z projektů vytvořených na časové ose.

Aplikace Pinnacle Studio musí sledovat veškeré materiály, které v projektu použijete, stejně jako veškeré úpravy na časové ose, trimování, přidávání efektů a další úkony. Většina těchto údajů se uchovává v souboru projektu ve formátu axp (formát filmu aplikace Pinnacle Studio). U fázové animace jsou projekty ukládány ve formátu axps.

Při práci s objemnými soubory je nutné šetřit místo na pevném disku, a proto soubor projektu neobsahuje položky médií vašeho filmu. U těchto položek se ukládá pouze jejich umístění.

Formát axp souboru projektu je výchozím formátem pro příkazy nabídky Soubor > Otevřít, Soubor > Uložit a Soubor > Uložit jako. Zřejmě se bude jednat o jediný formát, který budete potřebovat.

Někdy je ovšem vhodné mít všechny zdroje projektu v jednom snadno spravovatelném celku, který umožňuje jejich bezproblémovou archivaci a přenos či odesílání souborů. Tomuto účelu slouží alternativní formát souborů, axx (balíček projektu aplikace Pinnacle Studio), který v jediném souboru obsahuje veškeré materiály používané vaším projektem, včetně položek médií. Je zřejmé, že soubory v tomto formátu jsou podstatně větší než standardní soubory projektu.

Ačkoli projekt není možné upravovat přímo ve formátu balíčku projektu, v aplikaci Pinnacle Studio lze balíček projektu otevřít pomocí možnosti Soubor > Otevřít a zvolením přípony axx v poli přípon souboru. Aplikace Pinnacle Studio bez problémů projekt rozbalí a vytvoří novou položku knihovny pro rozbalenou verzi, kterou poté otevře pro úpravy.

Pokud vytvoříte projekt se záznamy z více kamer v Editoru více kamer, bude projekt uložen jako soubor mcam. Soubor mcam je ve výchozím nastavení na časovou osu přidán jako vnořený projekt. Můžete ho rozbalit dvojím kliknutím na soubor na časové ose a úpravou na odpovídající kartě časové osy. Všechny úpravy jsou uloženy do hlavního projektu.

S použitím poznámek k projektu můžete sledovat podrobnosti projektů, úlohy a poznámky recenzentů. Poznámky jsou strukturovány jako kontrolní seznam, díky čemuž je snadné odškrtávat dokončené nebo zkontrolované položky. K poznámkám k projektu můžete kdykoli přistupovat z otevřeného projektu. Můžete se také rozhodnout uložit poznámky k projektu jako soubor TXT ve stejném umístění jako soubor projektu.