Las películas y los discos que crea en Pinnacle Studio se extraen de los proyectos que genera en la línea de tiempo.

Para administrar los proyectos, Studio debe realizar el seguimiento de todo lo que tiene lugar en la línea de tiempo, así como de todas las decisiones de edición que se efectúan respecto a la adición de efectos, los recortes y un largo etcétera. La mayoría de esta información se guarda en el archivo de proyecto, que tiene el formato axp (película de Studio). Para Stop Motion, los proyectos se guardan en el formato axps.

Con el fin de disponer de espacio en el disco duro al utilizar archivos que pueden tener un tamaño muy grande, el archivo de proyecto no incluye elementos de medios en la película. Para estos, solamente se guarda su ubicación.

El archivo de proyecto axp es el formato de archivo predeterminado para los comandos de menú Archivo > Abrir, Archivo > Guardar y Archivo > Guardar como. Posiblemente sea el único que necesite.

Ahora bien, en ocasiones es preciso disponer de todos los recursos de un proyecto en una sola unidad para poder realizar cargas, transferencias o archivados sin problemas. Esta es la finalidad del formato de archivo axx (paquete de proyecto de Studio), que en un solo archivo contiene todo el material que se utiliza en el proyecto, incluidos los elementos de medios. Los archivos de este formato son, inevitablemente, mucho más grandes que los archivos de proyecto estándar.

Si bien no es posible editar un proyecto directamente en el formato de paquete, Pinnacle Studio permite abrir un paquete de proyecto con Archivo > Abrir y seleccionando axx en el cuadro de extensiones de archivo. Studio desempaqueta el proyecto sin problemas, crea una nueva entrada de Biblioteca para la versión desempaquetada y la abre para editar.

Si crea un proyecto multicámara en el Editor multicámara, el proyecto se guarda como archivo mcam. Cuando se añade un archivo mcam a la línea de tiempo, se añade como proyecto anidado de forma predeterminada. Puede ampliarlo haciendo doble clic en el archivo en la línea de tiempo y editándolo en la ficha de línea de tiempo correspondiente. Todas las modificaciocnes se guardan en el proyecto principal.

Puede realizar el seguimiento de los detalles, tareas y notas de revisión del proyecto mediante las Notas del proyecto. Las notas están estructuradas como una lista de comprobación, lo que facilita el marcado de los elementos que haya completado o revisado. Puede acceder a las notas del proyecto desde el proyecto abierto en cualquier momento. También puede elegir guardar sus notas del proyecto como archivo TXT en la misma ubicación que el archivo de proyecto.